8月24日，从省名特优水产品体系赣北试验站（九江市农业科学院）获悉，该院联合首席专家团队（南昌大学）、武宁县农业农村局等单位，成功组装了重要底栖经济鱼类蛇鮈（Saurogobio dabryi）的染色体水平基因组，首次获得蛇鮈染色体水平的高质量基因组和注释信息。相关结果于8月24日发表在国际学术期刊《Animals》（JCR 1区，中科院2区）上，在蛇鮈种质资源解析研究上取得重要进展。
蛇鮈是我国重要的淡水经济鱼类，隶属于鲤科鮈亚科，广泛分布于长江、黄河及珠江流域。蛇鮈也俗称棍子鱼，江西多地例如武宁、南昌地区一直都有爱吃棍子鱼的说法。作为典型的底栖鱼类，蛇鮈栖息于江河沙泥质河床，是河流食物网中重要的杂食性碎屑食者和次级消费者，也是河流生态系统健康的可靠生物指示种。此外，蛇鮈因其肉质细嫩、风味独特，已成为我国具有开发潜力的水产养殖对象。然而，长期以来缺乏高质量的参考基因组，严重制约了其在适应性进化、遗传育种及野生种群保护等方面的深入研究。
蛇鮈雌、雄性个体示意图 科研团队基于PacBio HiFi长读长测序、短读长测序及Hi-C 染色质互作技术，成功组装了蛇鮈染色体级别的基因组。最终组装基因组大小为1.09Gb，挂载至25条染色体，scaffold N50达43.15Mb，BUSCO完整性评估达98.39%，表明组装具有极高的连续性、完整性和准确性。团队进一步预测了26,036个蛋白质编码基因，其中25,898个基因（99.47%）获得了功能注释，并系统注释了重复序列和非编码RNA。比较基因组学分析明确了蛇鮈在鮈亚科中的系统发育地位，揭示其与鳅鮈（Gobio gobio）构成姐妹类群，分化时间约为1260万年前。 该研究得到了江西省名特优水产品产业技术体系专项基金（JXARS-15）以及江西省“赣鄱英才”支持计划——高校领军人才项目的资助。 这是蛇鮈基因组信息的首次发布，对于解析底栖鱼类适应性进化机制、理解鮈亚科物种分化及制定种质资源保护策略至关重要。该高质量基因组为蛇鮈的遗传改良、经济性状基因挖掘以及野生种群可持续管理提供了关键的遗传基础。接下来，科研团队还将致力于开展蛇鮈重要性状（如性别、生长）的分子机制研究及种质创新利用，助力我省淡水渔业高质量发展和水生生物多样性保护。（体系赣北试验站供稿） |
